Hvedesorter undersøges for egnethed til brødhvedeproduktion samtidig med, at metoder til test af brødhvedekvalitet og standarder for kvaliteten udarbejdes. Endelig undersøges grøngødningsafgrøders indflydelse på proteinindholdet i NIMAB-projektet.
I BAROF-projektet undersøges kvalitetsegenskaber ved forskellige sorter og sortsblandinger.
I afgrøder som brødhvede og frøgræs anvendes kvælstofgødskning til at fremme en bestemt udvikling - brødhvede øges proteinindholdet ved en sengødskning og i frøgræs fremmer sengødskningen udviklingen af frøstængler og frø. I disse tilfælde er selv en god forfrugt ikke tilstrækkeligt til at sikre den ønskede produktkvalitet. Derimod kan grøngødningsafgrøder indeholde store mængder kvælstof men kan de bruges i en målrettet gødskningsstrategi eksempelvis i brødhvede og frøgræs?
Den kemiske og ernæringsmæssige kvalitet af bælgsæd dyrket i renbestand og i samdyrkning med byg er undersøgt i GENESIS-projektet.
Kvaliteten af spisekartofler med forskellige gødningstyper er beskrevet af Anette Thybo, og der er også undersøgelser af kartoflers kvalitet i CARMINA-projektet.
Selve høstprocessen og opbevaringsforholdene for korn kan have betydning for kvaliteten, udviklingen af mycotoxiner m.m.